Cellbio和Partek合作发布了数据分析管道inDrop系统

单细胞分析巨头1 Cellbio和顶尖的生物信息软件公司Partek昨日合作发布了数据分析管道inDrop系统,它能顺利地在Partek Flow生物信息软件中运行。

 

该系统允许用户预处理原始的inDrop单细胞RNA-Seq数据,并使用Partek旗下先进的统计软件和可视化工具来描述和分析单个细胞。此外,有能力开发自定义inDrop应用程序的用户可以利用软件中提供的各种单细胞生物信息学工具,并使用直观的界面对其进行配置。

 

Partek旗下的单细胞RNA-Seq系统正在彻底改变复杂组织和疾病的研究,其可视化的特点和易于操作的指令工具使研究人员能够分析他们自己的单细胞RNA-Seq数据。首先,系统页面会使用交互式图表执行条形码和细胞过滤,以指导使用者的后续选择操作。其次,系统会自动叠加聚类结果、基因和途径表达、样本属性等,以帮助对3D t-SNE图上的细胞进行分类。最后,系统会自动识别细胞类型之间或治疗条件之间差异表达的基因和途径,有效节省研究人员的时间和精力。

 

Cellbio和Partek合作发布了数据分析管道inDrop系统

Partek Flow功能介绍页面

 

单细胞分析在生命科学界越来越受欢迎,并为生物工程和疾病治疗提供新颖的见解。它可用于多种应用,包括肿瘤分析、药物靶标验证、细胞间变异鉴定和谱系示踪。然而,生物信息学分析仍然是许多研究人员的难题,现有的传统解决方案已不能满足与日俱进的研究和应用需求。生物学界想要有所突破,就需要借用先进的计算机技术和内部信息学能力来弥补传统方案的不足。

 

现在,Partek Flow通过直观的点击界面使科学家能够轻松分析其scRNA-Seq数据,从而解决了这一问题。

 

当被问及合作伙伴关系时,Partek总裁Tom Downey表示:“与1CellBio合作的意义在于,我们为分析单细胞数据提供一种经济上负担得起且易于使用的解决方案,让科学家无需学习和使用过于专业的计算机技术就能尝试解决自己提出的研究问题。”

 

1CellBio首席执行官Colin J.H. Brenan博士则表示:“他们不仅提供一流的scRNA-seq分析解决方案,随着我们引入更多的单细胞应用,他们还将不断地革新现有技术来满足我们的需求。”

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发布日期:2019年03月03日  所属分类:医疗电子