2008年ebay曾宣布将弃用第三方支付系统，但由于面临第三方开发者的压力，2009年决定让通过审批的公司提供第三方支付服务。ebay要求第三方支付服务界面与自己的支付系统保持一致，同时ebay禁止商家利用支付信息销售商品。
最初允许第三方支付的原因，是ebay的结算存在显著的问题，在某些情况下可能给买方和卖方体验带来负面影响。最主要的原因包括：
税/增值税计：许多大型零售商需要企业级的税款计算。
促销：卖方往往要提供特别的服务如买二送一，或订单超过某一数额将免运费等等。
送货和交易：ebay只有非常有限的送货及处理选项。此外，ebay独家送货商是ups，无法使用联邦快递。
支付方式缺乏灵活性：实行无纸化支付后ebay基本上只用paypal，很多卖家也发现买家喜欢只用信用卡或进行大型b2b交易时需要发票/订单。
从现在到2011年6月还有比较长的时间，ebay还可对结算功能进行更多的改进。ebay宣布将从2011年6月30日起关闭第三方支付系统，此举意味着自此后ebay卖家将不得不使用ebay自身的结算服务。
ebay公司卖方体验副总裁托德·卢瓦克（todd lutwak）表示，ebay交易中只有不到10%涉及第三方支付，因此大多数卖方不会受关闭影响。
卢瓦克称，为了照顾这些受影响的卖方，公司将加强结算功能如增加高级税金报告、深入整合信用卡功能和高级出货解决方案等。卖方将在数周内收到服务商的信件，ebay也将与各方保持密切合作。
在2001年10月前，ebay实际上不存在任何结算。那时买方点击‘现在购买’或拍下拍卖的商品后，如何完成交易全部由买方和卖方负责。为了填补这一空白，公司后来推出革新的第三方支付应用，卖方只需向买方发送电子邮件，就可在后台完成交易。
